如果玩家在PS2游戏机上玩奥特曼格斗进化3时想要保存雷杰多，可以按照以下步骤进行。

首先，玩家需要确保游戏进行到了一个保存点，通常是在通关或特定操作后会自动触发保存。

接下来，玩家可以按下游戏手柄上的“Start”键，进入游戏菜单界面。

在菜单界面中，玩家可以选择“保存”选项，并且按照提示进行保存雷杰多。

完成保存后，玩家可以继续游戏，或者选择退出游戏。在下次玩游戏时，玩家可以载入之前保存的进度，继续进行游戏。